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No.R04P0181

プレシジョン・メディシン

~ビッグデータの構築・分析から臨床応用・課題まで~

出版日 2018年10月
価格
印刷タイプ 49,680円(税込)
ページ数 B5判 406ページ
発行<調査・編集> (株)エヌ・ティー・エス

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レポート内容

■ポイント■
 ・医療ビッグデータからはじまる予防・先制医療の幕開け、プレシジョン・メディシン研究の最前線を追う!
 ・医療革命を引き起こすと期待されるプレシジョン・メディシンの現状と臨床現場への実装の取組みを掲載!
 ・医療の専門家からデータ解析のスペシャリストまでそれぞれの立場から臨床応用への取組みを執筆!
 ・医療のパラダイムシフトをもたらすプレシジョン・メディシン、その最新動向を掲載!

-CONTENTS-

【序論 未病社会に必要なプレシジョン・メディシン】
 ―世界の現状と日本におけるプロジェクトの取組み―
 ・プレシジョン・メディシンの幕開け
 ・がんは遺伝子の病気
 ・日本人のゲノム情報
 ・日本特有でかつ世界標準のビッグデータベース構築
 ・本企画に関して

【第1編 データベース構築と解析・分析手法の開発】
<1>データベース構築
1.コンパニオン診断のためのデータベースの構築と臨床応用
 ・はじめに
 ・「BRACAnalysis診断法」の保険収載に関して
 ・コンパニオン診断法・診断薬各論
 ・検査データシェアリングについて
2.医療ビッグデータの構築と利活用術
 ・はじめに
 ・電子カルテを用いた医療ビッグデータ構築の課題
 ・大規模医療データベース構築の動き
 ・データを利活用する未来に向けて
3.がんゲノム医療用知識データベースの構築
 ・はじめに
 ・がんゲノム医療用知識データベースの背景
 ・知識データベースの事例
 ・知識データベースについて
 ・知識データベースの活用
 ・おわりに
4.PleSSision検査によるクリニカルシークエンスのネットワーク構築
 ・はじめに
 ・PleSSision検査の概要
 ・PleSSisionネットワークについて
 ・PleSSisionネットワークの今後の展望
 ・おわりに
5.クリニカルバイオバンクとクリニカルシークエンスのネットワーク構築
 ・はじめに
 ・クリニカルバイオバンクの必要性
 ・クリニカルバイオバンク学会
 ・生体試料の品質管理
 ・がんクリニカルシークエンス
 ・生体試料と臨床情報の収集とデータベース構築
 ・臨床情報とゲノム情報の収集と統合データベース構築
 ・おわりに

<2>データ解析・分析手法の開発
1.バイオインフォマティクスによる全ゲノムデータ分析手法の紹介
  ―HLA遺伝子型の推定とタイピング解析手法―
 ・はじめに
 ・HLA遺伝子の役割
 ・HLAタイピング手法
 ・全ゲノムSNPジェノタイピングデータをもとにしたHLA遺伝子型の推定(imputation)方法
 ・次世代シークエンスデータをもとにしたHLA遺伝子型推定アルゴリズム
 ・ネオアンチゲン解析
 ・TCR/BCRレパトア解析
 ・おわりに
2.東北メディカル・メガバンク計画におけるゲノム・オミックス統合解析
 ・はじめに
 ・東北メディカル・メガバンク計画
 ・ゲノム/オミックス解析基盤の構築
 ・未来型医療実装に向けた課題
3.がん遺伝子パネル検査におけるバイオインフォマティクス分析手法の開発
 ・がんの遺伝子パネル検査
 ・がん遺伝子パネル検査の実験設定
 ・情報システムと情報の流れ
 ・がん遺伝子パネル検査に必要なプログラムの開発
 ・先進医療、保険診療
4.大規模ゲノム・オミックスデータ解析と効率的なバイオマーカーの探索
 ・はじめに
 ・大規模オミックスデータにおける多重検定の問題
 ・大規模多重検定における最適発見手法
 ・治療効果予測因子の探索
 ・おわりに
5.診療情報ビッグデータの解析による医療の質向上と安全確保
 ・診療支援につながるデータ解析の必要性
 ・診療録記載における全文検索の必要性
 ・医療の質向上を見据えた診療プロセス支援システム
 ・診療情報ビッグデータの解析による医療の質向上と安全確保の実現
6.NGSをがんのプレシジョン・メディシンで利用するためのバイオインフォマティクスの動向
 ・はじめに
 ・がんパネルNGSの特色を生かしたsomatic mutationの検出
 ・検査室のためのバイオインフォマティクスパイプライン
 ・臨床医へのレポートのありかた
 ・多型データベースとがん変異データベース
7.ゲノムITクラウド構築の国内外動向
 ・ゲノム解析におけるIT環境の位置づけ
 ・解析対象の変化と海外の動き
 ・分散された国内環境の状況
 ・ICT業界の大きな変化
 ・海外でのICT環境の構築状況
 ・クラウド事業社のゲノム解析専門サービスの登場
 ・今後のゲノム解析のICT環境の変化
 ・将来のICT環境

<3>網羅的な遺伝子変異検査法の開発
1.がんゲノム医療に向けたプレシジョン・メディシンに関わる遺伝子関連検査の現状と課題
 ・はじめに
 ・遺伝子関連検査の背景
 ・遺伝子関連検査の現状
 ・遺伝子関連検査ガイドライン・学会情報
 ・次世代シークエンサーを用いた遺伝子解析の精度管理
 ・おわりに
2.OncoPrimeによる網羅的がん遺伝子検査
 ・はじめに
 ・OncoPrimeとは
 ・サービスの流れ
 ・検査実績
 ・今後の課題
 ・おわりに
3.がん関連遺伝子パネル検査システムの開発
 ・はじめに
 ・NCCオンコパネル検査の臨床研究―TOP-GEARプロジェクト(第二期)
 ・がん関連遺伝子パネル検査システムの社会実装―先進医療と体外診断薬の承認申請
 ・おわりに
4.高精度変異検出システムによるがん関連遺伝子の低頻度変異解析
 ・はじめに
 ・次世代シークエンスによる遺伝子変異検出
 ・分子バーコードを用いた精度向上
 ・おわりに
5.PleSSision検査によるがん関連遺伝子変異の網羅的解析
 ・はじめに
 ・PleSSision検査の流れ・特徴
 ・解析実績
 ・おわりに
6.体外診断用DNAチップキットの開発とプレシジョン・メディシンへの貢献
 ・はじめに
 ・DNAチップについて
 ・体外診断用医薬品「ジーンシリコンDNAチップキットUGT1A1」
 ・プレシジョン・メディシンへの貢献
 ・おわりに

【第2編 がんを中心とした治療分野におけるプレシジョン・メディシンの進展】
<1>クリニカルシークエンス技術
1.ゲノムワイド関連解析によるがん発症予測システムの開発
 ・はじめに
 ・疾患別解析
 ・おわりに
2.アジア発アジア人に最適化された実践的クリニカルシークエンスと創薬への挑戦
 ・クリニカルシークエンスの日本での展開
 ・台湾で最新のプレシジョン・メディシンを提供するACT Genomics社
 ・ACT Genomics社のサービス内容
 ・クリニカルシークエンスとバイオバンク、さらに創薬へ
 ・アクトメッド社の目指す方向性
3.ゲノム研究用およびゲノム診療用の病理組織検体取扱い規程
 ・ゲノム研究用病理組織検体取扱い規程
 ・ゲノム診療用病理組織検体取扱い規程
 ・ がんゲノム医療中核拠点病院、がんゲノム医療連携病院における研究用規程、診療用規程

<2>リキッドバイオプシーによるがん診断
1.体液中マイクロRNAによるがんの早期発見
 ・はじめに
 ・体液診断(リキッドバイオプシー)の進展
 ・血液中のDNAやmRNA、マイクロRNAはなぜ安定なのか
 ・エクソソームの基礎
 ・エクソソームの生物学的意義
 ・エクソソーム創薬
 ・体液マイクロRNAが診断ツールとなりうる可能性
 ・わが国の体液マイクロRNA診断の基盤技術開発プロジェクトが始動
 ・プロジェクトの進展と課題
 ・おわりに
2.血中循環腫瘍DNAによるリキッドバイオプシー診断システムの開発
 ・はじめに
 ・リキッドバイオプシー
 ・LBx Probe
 ・おわりに
3.がん患者へプレシジョン医療を提供するための循環腫瘍DNA解析
 ・はじめに
 ・リキッドバイオプシーの歴史
 ・循環腫瘍DNA(ctDNA)解析の臨床的意義
 ・循環腫瘍DNA(ctDNA)解析技術の発展
 ・リキッドバイオプシーによる消化器がん治療最適化を目指した研究
 ・ctDNA検出によるリキッドバイオプシーの臨床応用と限界
 ・おわりに
4.血液循環がん細胞(CTC)の検出方法と臨床への応用
 ・はじめに
 ・循環腫瘍細胞(CTC)
 ・CTC診断装置
 ・CTCの臨床応用
 ・おわりに
5.血液がんの変異遺伝子を標的とした個別化治療への応用
  ―血液がんにおけるPRECISION MEDICINE―
 ・はじめに
 ・診断への貢献
 ・予後予測
 ・微小残存病変
 ・分子標的治療
 ・生殖細胞系列変異
 ・Clonal hematopoiesis診断の意義
 ・骨髄系腫瘍
 ・リンパ系腫瘍
 ・血液がんにおけるリキッドバイオプシー

<3>効果的ながん免疫療法のためのバイオマーカー探索
1.免疫チェックポイント阻害薬のバイオマーカー
 ・はじめに
 ・免疫チェックポイント阻害薬反応性と関係するヒトがん免疫病態
 ・腫瘍組織バイオマーカー
 ・血液バイオマーカー
 ・おわりに
2.LC-SCRUM-Japanにおける希少遺伝子異常陽性肺がんの遺伝子スクリーニングと治療開発
 ・はじめに
 ・RET融合遺伝子の発見
 ・RET融合遺伝子の頻度
 ・全国規模の遺伝子スクリーニングネットワーク(LC-SCRUM-Japan)の構築
 ・LC-SCRUM-Japanにおける遺伝子スクリーニングの対象について
 ・Multiplex診断薬を導入した産学連携全国がんゲノムスクリーニング事業「SCRUM-Japan 」への発展
 ・LC-SCRUM-Japanにおける遺伝子スクリーニングの成果
 ・RET肺がんに対する治療開発
 ・ROS1肺がんに対するクリゾチニブの適応拡大
 ・BRAF遺伝子変異陽性肺がんに対するダブラフェニブ/トラメチニブの適応拡大
 ・がん免疫療法のバイオマーカー開発
 ・臨床ゲノムデータベースの確立
 ・おわりに
3.変異遺伝子を標的とした個別化がん免疫療法の開発
 ・はじめに
 ・これまでのがんワクチン療法
 ・遺伝子変異によるがん特異的抗原=ネオアンチゲン
 ・次世代シークエンス技術と個別化ネオアンチゲン
 ・バイオインフォマティクスによるエピトープ予測の現状
 ・個別化がんワクチンの実施例
 ・質量分析によるHLA結合ペプチドの同定
 ・T細胞移入療法
 ・おわりに
4.泌尿器がんにおけるプレシジョン・メディシンの現状
 ・はじめに
 ・前立腺がんにおけるプレシジョン・メディシンの現状
 ・腎がんにおけるプレシジョン・メディシンの現状
 ・尿路上皮がんにおけるプレシジョン・メディシンの現状
 ・おわりに

<4>がん以外の疾患におけるプレシジョン・メディシンの進展
1.虚血性心疾患感受性遺伝子とプレシジョン・メディシン
 ・世界初のゲノムワイド関連解析による虚血性心疾患感受性遺伝子の同定とプレシジョン・メディシンへの応用
 ・感受性分子の同定、解析からCADのプレシジョン・メディシン
 ・大規模ゲノム配列解析による低頻度バリアントの同定と創薬
 ・おわりに
2.2型糖尿病領域におけるプレシジョン・メディシン
 ・はじめに
 ・2型糖尿病のゲノム研究の現状
 ・糖尿病合併症のゲノム研究の現状
 ・ゲノム情報の2型糖尿病医療への応用
 ・おわりに
3.プレシジョン・メディシンの運動器疾患への応用
 ・はじめに
 ・骨系統疾患
 ・高齢者の運動器疾患
 ・運動器の慢性疼痛
4.プレシジョン・メディシンの腎臓内科疾患への応用
 ・はじめに
 ・腎臓内科疾患の生体試料バンクやコホート研究
 ・次世代シークエンサーを用いた遺伝性腎疾患の診断
 ・慢性腎臓病と疾患感受性遺伝子
 ・おわりに

【第3編 プレシジョン・メディシンに関わる社会制度と法的課題】
<1>プレシジョン・メディシンにおける保険診療の課題
 ・はじめに
 ・がん治療分野のプレシジョン・メディシンにかかる保険診療の現状
 ・がんゲノム医療実用化に向けた動き
 ・がん遺伝子パネル検査の費用負担の問題
 ・がん遺伝子パネル検査後の治療の選択肢と費用の問題
 ・がん治療における患者の費用負担の実態
 ・プレシジョン・メディシンと民間保険について
 ・プレシジョン・メディシンにおける保険診療の課題

<2>医療データにおける匿名化の動向と海外の事例
 ・医療データにおける匿名化の動向
 ・医療データの匿名化に関する海外事例
 ・National Cancer Database
 ・GlaxoSmithKline

<3>個人ゲノム情報の活用とプライバシー保護
 ・はじめに
 ・ゲノムデータの開示に伴うリスク
 ・国内法令上の扱い
 ・ゲノム情報保護の技術
 ・おわりに

<4>医療機関における医療・健診情報に関する改正個人情報保護法下での実務対応
 ・医療・健診情報の利活用と個人情報保護法の改正
 ・医療等情報の取得
 ・医療等情報の利用と第三者提供
 ・学術研究の用に供する場合における適用除外
 ・医療等情報のトレーサビリティの確保
 ・匿名加工情報としての医療等情報の取扱い
 ・外国にある第三者への医療等情報の提供
 ・次世代医療基盤法の下での医療等情報の取扱い
 ・今後の課題
 ・おわりに

■監修者■
佐藤 孝明
筑波大学プレシジョン・メディスン開発研究センター 特命教授/センター長
榊 佳之
東京大学名誉教授
松原 謙一
大阪大学名誉教授

■執筆者(執筆順55名)■
佐藤 孝明
筑波大学プレシジョン・メディスン開発研究センター 特命教授/センター長
佐々木 毅
東京大学大学院医学系研究科次世代病理情報連携学講座 特任教授
黒田 知宏
京都大学医学部附属病院 教授
西村 邦裕
(株)テンクー 代表取締役社長
林 秀幸
慶應義塾大学医学部腫瘍センターゲノム医療ユニット 特任助教
西原 広史
慶應義塾大学医学部腫瘍センターゲノム医療ユニット 特任教授
武藤 学
京都大学大学院医学研究科腫瘍薬物治療学講座 教授
白石 航也
国立研究開発法人国立がん研究センター研究所ゲノム生物学研究分野 ユニット長
木下 賢吾
東北大学東北メディカル・メガバンク機構 教授/副機構長 東北大学大学院情報科学研究科 教授
加藤 護
国立研究開発法人国立がん研究センター研究所バイオインフォマティクス部門 部門長
野間 久史
大学共同利用機関法人情報・システム研究機構統計数理研究所データ科学研究系 准教授
廣田 健一
札幌医科大学附属病院医療情報企画室 副室長
日紫喜 光良
東邦大学理学部 准教授
田村 卓郎
ライン(株) 代表取締役/筑波大学プレシジョン・メディスン開発研究センター 客員教授
喜多 剛志
(株)インターネットイニシアティブヘルスケア事業推進部 部長
中條 聖子
(株)エスアールエル検査統括部 担当課長
佐野 栄治
(株)エスアールエル検査統括部 部長
望月 洋明
三井情報(株)バイオサイエンス部バイオサイエンス室 コンサルタント
佐久間 朋寛
三井情報(株)バイオサイエンス部バイオサイエンス室 シニアマネージャー
鈴木 誓吾
シスメックス(株)技術戦略本部R&D 戦略部 シニアエキスパート
的場 亮
(株)DNA チップ研究所 代表取締役社長
毛利 涼
三菱スペース・ソフトウエア(株)関西事業部 バイオメディカルインフォマティクス開発室
谷嶋 成樹
三菱スペース・ソフトウエア(株)関西事業部 バイオメディカルインフォマティクス開発室 室長
岡村 浩
東洋鋼鈑(株)事業推進室 室長
松田 浩一
東京大学大学院新領域創成科学研究科 教授
岡野 和広
アクトメッド(株)営業・マーケティング部兼事業開発部 ゼネラルマネージャー
落谷 孝広
国立研究開発法人国立がん研究センター研究所分子細胞治療研究分野 プロジェクトリーダー
津矢田 明泰
(株)理研ジェネシス開発課 主任研究員
齋藤 辰朗
(株)理研ジェネシス医薬品開発支援室 室長
前佛 均
公益財団法人がん研究会がんプレシジョン医療研究センターリキッドバイオプシー診断開発プロジェクト 部長
黒川 宏美
筑波大学医学医療系橋渡し・臨床研究学 助教
松阪 諭
筑波大学医学医療系橋渡し・臨床研究学 教授
末原 泰人
筑波大学大学院人間総合科学研究科
日下部 学
筑波大学医学医療系血液内科 講師
坂田(柳元) 麻実子
筑波大学医学医療系血液内科 准教授
千葉 滋
筑波大学医学医療系血液内科 教授
河上 裕
慶應義塾大学医学部先端医科学研究所細胞情報研究部門 所長/教授
後藤 功一
国立研究開発法人国立がん研究センター東病院呼吸器内科 呼吸器内科長
紅露 拓
地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立がんセンター臨床研究所がん免疫療法研究開発学部 研究員
笹田 哲朗
地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立がんセンター臨床研究所がん免疫療法研究開発学部 部長
小島 崇宏
筑波大学医学医療系腎泌尿器外科 講師
神鳥 周也
筑波大学医学医療系腎泌尿器外科 講師
西山 博之
筑波大学医学医療系腎泌尿器外科 教授
尾崎 浩一
国立研究開発法人国立長寿医療研究センターメディカルゲノムセンター・臨床ゲノム解析推進部 部長
前田 士郎
琉球大学大学院医学研究科 教授
渡辺 研
国立研究開発法人国立長寿医療研究センター運動器疾患研究部 室長
臼井 丈一
筑波大学医学医療系臨床医学域腎臓内科学 准教授
山縣 邦弘
筑波大学医学医療系臨床医学域腎臓内科学 教授
黒田 尚子
黒田尚子FP オフィス 代表/ファイナンシャル・プランナー
美馬 正司
(株)日立コンサルティング公共コンサルティング本部 ディレクター
清水 佳奈
早稲田大学理工学術院 教授
藤池 智則
堀総合法律事務所 弁護士
冨松 宏之
堀総合法律事務所 弁護士

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